在白垩纪晚期（7000万年前），有一种类似大型暴龙的兽脚类恐龙，但具有特殊的两栖适应性，使其能够在其捕猎的岛屿之间游泳。这种恐龙被称为“哥吉拉龙”。
哥吉拉龙的最小繁殖种群以某种方式在这场导致其他恐龙灭绝的大灭绝事件中幸存下来，并一直延续到现代。（就像许多人认为蛇颈龙的繁殖种群幸存下来并成为现代“湖怪”一样。）帮助哥吉拉龙生存的适应能力可能包括长时间休眠以及忍受高温和辐射环境的能力就像人类很少侵入的活跃火山地区一样。生活在南太平洋的哥吉拉龙只有在极少数情况下才会被简单渔村的岛上居民观察到，他们将这些奇怪的野兽的故事融入到他们的民间传说中。
显然，除了一只（或者两只）外，所有哥吉拉龙都在第二次世界大战中被消灭。一只哥吉拉龙在盟军的袭击中受了重伤，但在偏远的拉各斯岛（靠近南太平洋马绍尔群岛）上幸存下来，直到战后核试验导致它受到巨大剂量的辐射。辐射导致哥吉拉龙已经适应辐射的生理机能迅速变异/适应。这种动物不断生长、变化，直到哥吉拉龙发展成为一种全新的生物……哥斯拉！
哥斯拉被美军打成重伤后，只能等死，十年后，由于太平洋原子试验的辐射，哥斯拉变异成了一个巨大的喷火怪物。在电影《哥斯拉大战王基多拉》中，详细探讨了哥斯拉的起源。他的起源被来自未来的时间旅行者修改，受伤的哥斯拉龙被传送到白令海，在那里，今天的一艘核潜艇发生事故，创造了一只更大、更强大的哥斯拉。
1998年三星电影《哥斯拉》中的哥斯拉也是由核试验创造的。尽管在这部电影中哥斯拉是一只放大的鬣蜥，而不是一只沉睡的恐龙。
有人说英二的灵感来自于美国电影《来自两万噚的野兽》。其他人则假装哥斯拉的灵感来自福龙丸事件。1954年，一艘渔船在比基尼环礁原子试验场周围海域误入歧途。返回日本后，船员们患上了一种奇怪的疾病，其中一人因此死亡。恐慌席卷全国，因怀疑受到污染而下令召回金枪鱼。日本媒体将此事件称为“人类第二次原子弹爆炸”。” — Markalite，1991 年秋季
1985年之前在德国上映的一些哥斯拉电影中，故事情节发生了变化，哥斯拉的许多对手要么是弗兰肯斯坦博士派来的，要么是他创造的。
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